2003年，继上海所、中检院之后全国第三个通过国家实验室认可；在全国省级食药检所中第一个取得国家局医疗器械检验资格。2004年成立中华人民共和国广西口岸药品检验所。2008年，被国家认监委列入第一批具有三聚氰胺检测能力的实验室。2011年，广西首家通过食品检验机构资质认定；获准成立广西食品药品安全评价人才小高地。2012年，成为广西第一家获得国家局化妆品行政许可检验资质的机构，填补了广西空白。2013年，是广西第二家获得国家食品复检机构的实验室；获批为广西食品药品安全检测工程技术研究中心，填补了我区工程技术研究中心中食品药品检验检测领域空白。2014年，取得保健食品注册检验机构资质；顺利通过CMA-F、CNAS食品复评审及扩项评审。目前，取得CMA认证458项，CMAF认证735项，CNAS认可1200项180个产品。
积极参与国家、广西自然科学基金、“十二五”重大科技专项等科研课题的研究，完成“十一五”国家科技支撑计划项目、国家科技重大专项课题。2009年“复方丹参片补充检验方法”获中国食品药品质量监测技术成就奖；2010年被授予全国“药品质量标准研究先进单位”称号；2011年度荣获中国药学发展奖食品药品质量检测技术奖标准贡献奖；2013年，“广西壮药法定质量标准体系规范化研究”荣获广西科技进步二等奖；2014年，荣获2014年中国药学会科学技术奖三等奖。平均每年发表学术论文40多篇。
拥有液-质及气-质联用仪、致病菌快速检测系统等20万元以上大型精密仪器185台件，仪器装备向专业化、自动化和智能化发展。设备总额由2000年的800多万元，发展到目前的1.3亿元，在区内食品药品相关检验机构中位列第一，在全国省级食品药品检验机构中名列前茅。
