为实施创新驱动发展战略,支撑云南有色金属支柱产业发展,解决云南省复杂有色金属资源选冶基础理论、关键技术及装备、提高资源综合利用率等方面的问题,建设区域高水平大学,云南省科技厅提出云南省与科技部共同支持昆明理工大学建设复杂有色金属资源清洁利用国家重点实验室,并于2013年科技部与云南省工作会商初步达成共识。2014年经遴选论证,科技部和云南省人民政府共同发文批准“部省共建复杂有色金属资源清洁利用国家重点实验室”,这是云南省第一家获批建设的部省共建国家重点实验室,也是第一家依托云南高等学校建设的国家重点实验室。