专家信息：
魏冬青，男，上海交通大学生物信息与生物统计系教授。Springer期刊“Interdisciplinary Sciences”(交叉科学)主编，“J. Atomic and Molecular Physics” 执行主编之一，中国数学力学物理学高新技术交叉研究学会副理事长兼生物信息学专业委员会主任委员，中国科学院计算化学虚拟实验室成员，中国兵工学会兵器材料动态力学专业委员会委员，“Molecular Simulation”原子分子物理学报等五家杂志编委。作为大会主席主持召开2008年理论与计算化学国际会议(TACC 2008)，第二届IEEE生物信息学及生物医学工程大会( Bioinformatics and Biomedical Engineering Conferences)以及计算与系统生物学国际会议（International Conference on Computational and System Biology）。
学习及工作经历：
1.1987年在美属波多黎各大学获化学物理学博士学位；
2.1987年8月-1992年12月加拿大不列颠哥伦比亚大学做博士后研究和Research Associate；
3.1993年1月-2002年12月加拿大计算及其应用研究中心任Research Scientist(Research Scientist Research Center on Computation and Its Application)；
4.2003年1月-2006年1月，天津市及天津师大特聘教授（海河学者），天津大学博士生导师，天津生物信息与药物开发研究所所长；
5.2006年2月起任上海交通大学生物信息与生物统计系教授，博士生导师，常务副主任。
科学研究：
研究方向：
魏教授长期从事结构生物信息学， 计算机辅助药物设计， 量子分子动力学， 复杂体系的统计力学，铁电液晶和新型含能材料的基础理论研究，生物学理论建模，生物学数据库设计和软件开发方面的研究。
承担的科研项目情况：
1.“药物代谢酶SNPs与药物的类药性一体化预测软件的研究与开发”， 国家863计划生物信息专项，项目编号：2007AA02Z333，2007-2011，项目主持人；
2.“阿尔茨海默氏症天然药物的设计、筛选以及相关的理论研究”，国家自然科学基金，项目编号：30870476，2009-2011， 项目主持人；
3.“复杂环境化学反应体系的理论计算方法与应用研究”，国家自然科学基金，项目编号：20773085， 2008-2010，项目主持人；
4.“与重大疾病相关的淀粉纤维蛋白的聚集机理的理论研究”，国家自然科学基金，项目编号：30770502，2008-2009，第一参与人；
5.“含能分子液体的量子分子动力学研究”，国家自然科学基金-中国工程物理研究院联合基金，项目编号：10376024，2004-2006年，项目主持人；
6.“统一的亲水-亲脂势及在药物设计中的应用”，国家自然科学基金，项目编号：20373048，2004-2006年，第一参加人；
7.“药物设计的方法创新和抗生素先导化合物的研究”，天津市科委自然基金重点项目，项目编号：033801911，2003-2005年，项目主持人；
8.“广谱抗病毒天然药物先导化合物的发现与优化”，天津市科委自然基金重大攻关项目，2004-2006年，项目主持人。
研究成果：
首次从理论上证明了铁电液晶的存在，论文发表在《物理学评论快讯》以及《物理学评论》上，并被广泛引用(350次)。它解决了统计物理上长期困扰的问题，这个问题是1916年由玻恩(Max Born)提出来的，即偶极相互作用可能形成方向有序的液体状态。他使人们认识到这个简单的体系包涵复杂的相结构和有趣的物理现象。同时这一发现开拓了液晶研究的新领域，即研究近球状分子形成的铁电液晶，著名的物理学家M. E. van Leeuwen and B. Smit指出( Phys. Rev. Lett. 71, 3991-3994 (1993))魏和Patey关于软球的分子动力学模拟代表了最早的贡献(the first contribution), 它证明了偶极相互作用力单独可以生成方向有序的液体状态，在高密度时变成铁电固体，也是首次证明了向列铁电液体的存在。B. Groh and S. Dietrich( Phys. Rev. Lett. 72, 2422 (1994))指出不管从物理本质还是技术应用来说都是很有意义的因为这个相不仅是向列的而且是铁电的。
发表论文：
1. Qishi Du, Shuqing Wang, Zhiqin Jiang, Weina Gao, Yun Li, Dongqing Wei, and Kuo-Chen Chou, “Application of Bioinformatics and Distorted Key Theory to Find Drug Candidates against SARS”, Medicinal Chemistry, 1，173 (2005).
2. Suzanne Sirois, G.M. Tsoukas, K.C. Chou, Dongqing Wei, C. Boucher, & G.E. Hatzakis, Selection of molecular descriptors with artificial intelligence for the understanding of HIV-1 protease peptidomimetic inhibitors-activity. Medicinal Chemistry, in press.
3. Qi-Shi Du, Peng-Jun Liu, Jun-Min Xie, Shu-Qing Wang, Dong-Qing Wei, Dennis Salahub， “Intermolecular Potential for Methane Hydrates”, J. Chem. Phys., in press.
4. Qishi Du, Shuqing Wang, Dongqing Wei, Suzanne Sirois, and Kuo-Chen Chou , “Molecular Modelling and Chemical Modification for Finding Peptide Inhibitor against SARS CoV Mpro" Analytical Biochemistry，337, 262-270（2005）.
5. Suzanne Sirois, Dong-Qing Wei, Kuo-Chen Chou and Qishi Du, “Assessment of Databases And Chemical Libraries For Their Druggability”, Computational Biology & Chemistry, 29, 55–67(2005).
6. Mei Dong, Xin Zhang, Aixiu Li and Dongqing Wei, “The Structure and Functions of the PEVK Poly- peptide Domain of Muscle Titin Protein”, Chemistry of Life, 25, 113(2004).
7. Qi-Shi Du, Shu-Qing Wang, Yu Zhu, Dongqing Wei, Hong Guo, Suzanne Sirois, Kuo-Chen Chou, “Cleavage Mechanism of Polyprotein by SARS CoV Mpro and Chemical Modification of Octapeptide” Peptide, 25, 1857-1864 （2004）.
8. Suzanne Sirois, Dong-Qing Wei, Qishi Du, Kuo-Chen Chou, “Virtual Screening for SARS-CoV Protease Based on KZ7088 Pharmacophore Points”, J. Chem. Info. Comput. Sci., 44, 1111, 2004.
9. Qishi Du and Dongqing Wei , “Application of the Bridge Functions on the RISM-HNC and Improvement of Solvation Free Energy Calculations ”, Acta Chimica Sinica, 62, 120, 2004.
10. Qishi Du, Dongqing Wei and Aixiu Li, “Quantum Chemical Description for Molecular Lipophilicity and Hydrophilicity: I. Molecular Lipophilic and Hydrophilic Surface”, Chemical Journal of Chinese Universities, 25, 1706(2004).
11. Du Qishi, Wang Shuqing, Wei Dongqing, Li Aixiu, “Study of Amino Acids Correlation in Proteins and Application in Structural Analysis”, Chemical Journal on Internet(CJI), 6, 40, 2004.
12. Shuqing Wang, Hong Li, Qishi Du, Dongqing Wei, “Amino Acid Principal Component Analysis for Protein structural Study and Its Application in Structure Prediction”, Acta Physico-Chimica Sinica , 20, 498, 2004.
13. K. C. Chou, D. Q. Wei, and W.Z. Zhong, Binding Mechanism of Coronavirus Main Proteinase With Ligands and its Implication to Drug Design Against SARS, Biochemical and Biophysical Research Communications, 308, 148(2003).
14. Qishi Du, Dongqing Wei, Kuo-Chen Chou，“Correlations of Amino Acids in Proteins”, Peptides, 24, 1863(2003).
15. Qishi Du and Dongqing Wei , “Solvation and Polarization of NMA Molecule in Aqueous Solution: A Combined Study of Ab Initio Quantum Mechanics and Integral Equation Theory in Three-Dimensions”, J. Phys. Chem. B, 107, 13463 – 13470(2003).
16. S.A. Decker, T.K. Woo, D. Wei, and F. Zhang, "Ab Initio Molecular Dynamics Simulations of Multimolecular Collisions of Nitromethane and Compressed Liquid Nitromethane" Proceedings of the 12th International Detonation Symposium, August 2002, San Diego.
17. D.Q. Wei, J.F. Trochun, Suzanne Sirois and D.R. Salahub, “Solvation of Formic Acid and Proton Transfer in Hydrated Clusters”, J. Chem. Phys., 116, 6028(2002).
18. D.Q. Wei, F. Zhang and T. K. Woo, “First-Principle Simulations of Energetic Molecular Liquids”, AIP Conference Proceedings, 620, 407-410(2002).
19. D. Q. Wei, Hong Guo and D.R. Salahub, "Conformational Dynamics of an Alanine Dipeptide Analogue: an Ab Initio Molecular Dynamics Study", Phys. Rev. E., 64, 011907(2001).
20. Radu Iftimie, Dennis Salahub, D. Q. Wei, Jeremy Schofield "Using a Classical Potential as an Efficient Importance Function for Sampling From an Ab Initio Potential", J. Chem. Phys., 113, 4852(2000).
21. D. Q. Wei, E. I. Proynov, A. Milet, and D. R. Salahub, "Solvation of the Hydroxide Anion: A DFT Study Using Several Exchange-correlation Functionals", J. Phys. Chem., 104, 2384(2000).
22. D.Q. Wei and D.R. Salahub, "DFT Ab Initio Molecular Dynamics and Combined DFT and Molecular Dynamics Simulations", in Combined Quantum Mechanical and Molecular Mechanical Methods, Eds, J. Gao and Mark Thompson, John Wiley, 1999.
23. D.R. Salahub, Ana Martinez and D.Q. Wei, "Structure, Reactivity and Dynamics of Atomic and Molecular Clusters Using Density Functional Theory(DFT) and other Tools", in Theory of Molecular and Atomic Clusters: With a Look at Experiments(Cluster Physics), Eds, J. Jellinek, Springer, 1999.
24. D.R. Berard, D.Q Wei, and D.R. Salahub, "Towards a Density Functional Approach of Chemical Reactions in Complex Media", Proceeding of Pacific Symposium on Biocomputing, 1997, R.B. Altman, A.K. Dunker, L. Junter and T.E. Klein, World Scientific Publishing Co., Hawaii, 51-61, 1997.
25. G. Ayton, D.Q. Wei and G.N. Patey, "Liquid Crystal Phases of Dipolar Discotic Particles", Phys. Rev., E, 55, 447, 1997.
26. D.Q. Wei, "Theory and Simulation of Strongly Interacting Dipolar Fluids: Ferroelectric Liquid Crystals, Ferrofluids and Electrorheological Fluids", Proceeding of the First International Conference on Frontiers of Physics: Looking to the21st Century, World Scientific, Singapore, 1997.
27. D.Q. Wei, D.R. Salahub, "Hydrated Proton Clusters: Ab Initio Molecular Dynamics and Simulated Annealing", J. Chem. Phys., 106, 6086(1997).
28. R.C. Dunbar, T.B., McMahon, D. Tholmann, D.S. Tonner, D.R. Salahub and D.Q. Wei, "Zero- pressure Thermal Radiation Induced Dissociation of Gas-phase Cluster Ions: Comparison of Theory and Experiment for (H2O)2Cl- and (H2O)3Cl-", J. Am. Chem. Soc., 117, 12819, 1995.
29. D.Q. Wei, "Orientational Order in Polar Liquids, Effect of Quadrupole Moment", Mol. Crystals and Liq. Crystals, 269, 89(1995).
30. D.Q. Wei and L. Blum, "Solvation Thermodynamic Functions as Given by the Mean Spherical Approximation and Their Behavior Near the Critical Region of Solvent", J. Chem. Phys., 102, 4217(1995).
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33. D.Q. Wei, "Field Induced Phase Transition of Simple Dipolar Fluids", Phys. Rev., E., 49, No. 3, 1994.
34. Chandra, D.Q. Wei and G.N. Patey, "Microscopic Theory of Solvation Dynamic in Polar Liquids", J. Chem. Phys., 99, 4926(1993).
35. D.Q. Wei, G.M. Torrie and G.N. Patey, "Molecular Solvent Model For an Electrical Double Layer: Effect of Ionic Polarizability", J. Chem. Phys., 99, 3990(1993).
36. Chandra, D.Q. Wei and G.N. Patey, "The Frequency Dependent Conductivity of Electrolyte Solutions", J. Chem. Phys., 99, 2083(1993).
37. Chandra, D.Q. Wei and G.N. Patey, "Dielectric Relaxation of Dipolar Liquids", J. Chem. Phys., 99, 2068(1993).
38. Chandra, D.Q. Wei and G.N. Patey, "Dielectric Relaxation of Electrolyte Solutions: Is There Really a Kinetic Dielectric Decrement?", J. Chem. Phys., 98, 4959(1993).
39. D.Q. Wei and G.N. Patey, "Dynamical Properties of a Ferroelectric Nematic Liquid Crystal", Phys. Rev., E, 47, 2954(1993).
40. D.Q. Wei and G.N. Patey, "Orientational Order in Simple Dipolar Liquids: Density Functional Theory and Absolute Stability Conditions", Phys. Rev. E, 47, 506(1993).
41. D.Q. Wei and G.N. Patey, "Ferroelectric Liquid Crystal and Solid Phases Formed by Strongly Interacting Dipolar Spheres", Phys. Rev., A, 46, 7783, 1992.
42. D.Q. Wei and G.N. Patey, "Orientational Order in Simple Dipolar Liquids: Computer Simulation of a Ferroelectric Nematic Phase", Phys. Rev. Letter, 68, 2043,1992.
43. P. Attard, D.Q. Wei and G.N. Patey, "On the Existence of Exact Conditions in the Theory of Electrical Double Layers", J. Chem. Phys. 96, 3767, 1992.
44. C.P. Ursenbach, D.Q. Wei and G.N. Patey, "Activity Coefficient of Model Aqueous Electrolyte Solutions: Sensitivity to the Short Range Part of the Inter-ionic Potential", J. Chem. Phys. 94, 6782 (1991).
45. D.Q. Wei and G.N. Patey, "Dielectric Relaxation of Electrolyte Solution", J. Chem. Phys. 94, 6795 (1991).
46. D.Q. Wei and G.N. Patey, "Dielectric Relaxation of Liquid Mixtures", J. Chem. Phys. 94, 6806 (1991).
47. P. Attard, D.Q. Wei and G.N. Patey, "The Interaction Between Macroparticles in Molecular Fluids", J. Chem. Phys. 93, 7360 (1990).
48. P. Attard, D.Q. Wei and G.N. Patey, "Critical Comments on The Nonlocal Dielectric Function Employed in Recent Theories of the Hydration Force", Chem. Phys. Lett., 172, 69 (1990).
49. D.Q. Wei and G.N. Patey, "Dynamics of Molecular Liquids: a Comparison of Different Theories with Application to Wave Vector Dependent Dielectric Relaxation and Ion Solvation", J. Chem. Phys. 93, 1399 (1990).
50. D.Q. Wei, G.N. Patey and G.M. Torrie, "Double Layer Structure at an Ion-adsorbing Surface", J. Phys. Chem. 94, 4260 (1990).
51. D.Q. Wei and G. Patey, "Rational Motion in Molecular Liquids", J. Chem. Phys. 91, 7113 (1989).
52. D.Q. Wei and L. Blum, "Nonprimitive Model of Electrolyte: Analytical Solution of The Mean Spherical Approximation For an Arbitrary Mixture of Sticky Ions and Dipoles", J. Chem. Phys. 89, 1091 (1988).
53. 代谢网络流分析进展及应用 陈琦; 王卓; 魏冬青; 科学通报 2010-05-15
54. 受磷蛋白的空间结构及其分子动力学模拟 汤孛; 巩克; 王靖方; 李亦学; 魏冬青; 科学通报 2010-03- 25
55. 细胞色素酶2D6的分子对接以及分子动力学研究 王靖方; 张成城; 魏冬青; 科学通报 2010-01-05
56. 碳环类神经氨酸酶抑制剂的2D-QSAR研究 郑会勤; 李云; 蒋志勤; 杜奇石; 魏冬青 ; 天津师范大学学报(自然科学版) 2006-12-30
57. 高压下TATB压缩性质的LDA和GGA比较研究 刘红; 赵纪军; 龚自正; 郑伟; 杜建国; 姬广富; 魏冬青; 原子与分子物理学报 2007-04-25
58. 分子模拟在生物化学中的应用实例 王春芳; 王靖方; 栗琳; 魏冬青; 原子与分子物理学报 2007-04-25
59. 药物基因组学与个性化药物设计研究进展 张瑞; 魏冬青; 魏华春; 屈凌波; 李如林; 陈超; 李亦学; 药学进展 2007-06-25
60. 偶极流体的理论研究 王英杰; 魏冬青; 王璐; 龚自正; 郭永新; 原子与分子物理学报 2007-06-25
61. 铝团簇Al_(13)的结构、电子性质和氧原子吸附的第一原理计算 王璐; 赵纪军; 王英杰; 龚自正; 郭永新; 魏冬青; 原子与分子物理学报 2007-06-25
62. HIV蛋白酶抑制剂的定量构效关系研究及其指导下的修饰 高慧; 王春芳; 高维娜; 李云; 魏冬青; 原子与分子物理学报 2007-08-25
63. H5N1血凝素蛋白切割位点的序列研究 郭晓莉; 朱贻盛; 李亦学; 石萍; 周豪魁; 姚劲松; 黄振德; 魏冬青; 科学通报 2007-08-30
64. 木糖还原酶定点突变设计的生物信息学分析 杜红丽; 王靖方; 曾琦锴; 凌飞; 魏冬青; 林影; 王小宁; 华南理工大学学报(自然科学版) 2008-12-15
65. CYP2C19基因与药物代谢相关性研究进展 杜红丽; 王靖方; 崔建勋; 凌飞; 魏冬青; 王小宁; 广东药学院学报 2008-10-15
66. 同半胱氨酸腺苷水解酶抑制剂的虚拟筛选和设计 魏华春; 张瑞; 李爱秀; 魏冬青 ; 中国化学会第二十五届学术年会论文摘要集（上册） 2006-07-01
67. 药物代谢酶P450 的计算生物学研究 王靖方; 魏冬青; 中国数学力学物理学高新技术交叉研究学会第十二届学术年会论文集 2008-08-01
发明专利：
魏冬青，周国城，甘一如，杜奇石， “一种抑制冠状病毒的多肽及其衍生物”，专利号：ZL 2004 1 0018679.3， 2006年一月。
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