张延——上海交通大学系统生物医学研究院研究员

专家信息：

张延，女，1963年8月出生，汉族。上海交通大学系统生物医学研究院研究员，系统生物医学研究院糖生物学和糖组学实验室课题组长，博士生导师，SCSB-AIST中日医学糖组学联合实验室中方主任，2007年上海市浦江人才。

教育及工作经历：

1982-1986， 山东大学微生物学专业 本科。

1991-1993， 日本东京大学应用生物工程专业 硕士研究生。

1993-1996， 日本东京大学应用生物工程专业 博士研究生。

1986-1989， 上海交通大学生物与技术系 助教。

1996-2001， 日本产业技术综合研究所，分子生物学研究部 博士后。

2001-2004， 日本产业技术综合研究所医学糖科学研究中心 助理研究员。

2004-2006， 日本国立动物卫生研究所免疫研究部 特别研究员。 

2006-至今，上海交通大学系统生物医学研究院 研究员、课题组长，兼任中日医学糖组学联合实验室 中方主任。

学术兼职及社会任职：

1. 中国生物化学与分子生物学会第五届复合糖专业委员会 常务委员（2010.08-2014.08）。

2. 中国生物工程学会第二届糖生物工程专业委员会 常务委员（2012.03-）。

3. 中国生物化学与分子生物学会第三届蛋白质组学专业委员会 委员（2011.04-2015.04）。

4. 亚洲糖生物学组织联盟(ACGG) 成员。

5. 江南大学 客座教授；江南大学糖化学与生物学技术教育部重点实验室 学术委员。

主讲课程： 

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培养研究生情况：

出站博士后1人，博士生4人，硕士生2人

在读博士生5人，在读硕士生4人

研究方向：

1. 肿瘤功能糖生物学 ：（糖基转移酶功能 、蛋白质O-GalNAc糖基化调控机制、糖链在肿瘤细胞中的变化规律和调控机制）

肿瘤细胞的异常糖基化现象早已被报道，目前对这一现象所涉及的机理和造成的影响却仍然所知甚少。糖基转移酶是肿瘤细胞表面O-糖基化的基础，它决定着肿瘤细胞表面糖蛋白O-糖基化的数量和结构种类。本实验室从糖基转移酶着手，致力于阐明糖基化这一重要翻译后修饰与癌症的关系。

我们研究发现了一种新的定位于内质网的蛋白质O-糖基化调控关键酶多肽N-乙酰氨基半乳糖基转移酶（ppGalNAc-T18），该酶只存在于脊椎动物，虽不具有经典的糖基化活性，但是可以选择性地促进同家族其他酶的糖基化活性，影响细胞表面蛋白的糖基化及细胞生长。该研究对教科书上关于蛋白质的O-GalNAc糖基化过程只发生在高尔基体中这一传统观念提出挑战，首次提出了内质网中可能存在新的蛋白质O-GalNAc糖基化调控机制。该成果发表在国际糖生物学研究领域权威杂志Glycobiology上（Glycobiology 2012, 22(5): 602-615）。

图1. (A) Veterbrate-specific T18 localized in ER rather than Golgi. (B) T18 lacks catalytic activity, but can selectively enhance the activity of other ppGalNAc-Ts. (C) Knockdown of T18 inhibited the cell growth, changed the cell morphology, and altered the cell O-glycosylation level. 

2. 疾病蛋白质组学和糖组学 （临床血清蛋白质组学和代谢组学 、蛋白质糖基化修饰系统生物学研究）

随着分析技术的不断发展，蛋白质组学、代谢组学及糖组学研究为人类进行疾病的诊断防治和新药开发提供重要的理论基础。同时，研究疾病特异性蛋白质的翻译后修饰，为疾病提供了新的治疗方案。这些组学研究已经在医学领域中显示出其广泛的应用前景，而且其技术及应用还在不断突破中。

1）临床血清蛋白质组学研究

运用相对定量血清蛋白质组学和分子生物学研究技术，我们系统性地解析了不同分期结直肠癌病人血清、组织样本中细胞外基质组分--I型胶原蛋白在结直肠癌发生发展中的生物学行为。首次发现肿瘤病人血清中I型胶原蛋白的代谢性降解产物羧基末端肽（CTx）的含量与结直肠癌病人的分期呈正相关，血清中CTx的变化与病人的预后生存期相关。表明血清中CTx标志物检测对结直肠癌预后的临床诊断具有参考意义。研究提示伴随肿瘤生长所产生的代谢性特异降解多肽片段，是未来血清肿瘤生物标志物发现的重要目标候选分子群。研究同时为血清蛋白组学手段在临床检测上的应用提供了功能组织学佐证。该成果发表在欧洲蛋白质组学协会的Jounal of Proteomics杂志上(Jounal of Proteomics,2013,94:473-485)。

 

图2. Up-regulation of type I collagen during tumorigenesis of colorectal cancer revealed by quantitative proteomic analysis 

2）临床代谢组学研究

基于代谢组学技术平台，我们共鉴定出249种人体血清代谢物，并建立了具有良好预测能力的结直肠癌病人与健康对照者的判别模型。基于统计分析，我们最终筛选出6种与结直肠癌密切相关的具有代表性的候补代谢标志物，建立了具有临床应用探索价值的诊断模型。本研究中，我们系统地观察到了结直肠癌病人体内代谢紊乱的现象。并首次比较全面地从血清代谢谱上观察到结直肠癌病人体内异常加剧的脂肪酸合成与脂肪酸氧化代谢，该结果是对目前关于癌症有氧糖酵解（Warburg effect）现象的又一种重要补充。另外，我们还发现了具有结直肠癌特异性的肠道菌群代谢异常现象。这些结果将有助于揭示结直肠癌发病的分子机制，为结直肠癌的早期诊断、疗效评价、新药开发、及合理饮食提供重要参考依据。本研究的相关成果发表在Journal of Proteome Research杂志上（JPR 2012,11(2): 1354-1363; JPR 2013,12(6): 3000-3009）。

3）蛋白质糖基化修饰系统生物学研究

O-GalNAc糖基化的起始步骤由ppGalNAc-T家族催化完成。ppGalNAc-T家族在人体中有20个成员，其中15个具有催化活性。ppGalNAc-T家族成员具有不同的组织分布和底物特异性，共同对蛋白质O-糖基化进行调控。目前已经发现的O-糖蛋白还很少，为了发现更多O-糖蛋白，理解ppGalNAc-T和底物之间的作用关系，我们开发了一种高通量筛选ppGalNAc-T底物的方法。这种方法结合了蛋白质组芯片的高通量筛选能力和click反应的高特异性，使用ppGalNAc-T天然底物的类似物UDP-GalNAz作为供体底物，在芯片上进行糖基化反应后，使用炔基荧光探针来检测被糖基化的蛋白。我们用该方法对ppGalNAc-T2的底物进行筛选，得到了226个候选底物。这些候选底物中膜相关蛋白高度富集，但是也包括一些胞浆和核定位蛋白。我们对底物集中的p53和酪氨酸激酶相关通路中选择的候选底物在体外全部得到了验证。我们还通过质谱鉴定了p53的体外糖基化位点，并在细胞内发现p53确实有O-GaNAc糖基化修饰，但是其具体功能还有待进一步研究。这一方法也可以用于其它ppGalNAc-T成员的大规模底物筛选，得到ppGalNAc-T与底物的相互作用网络，帮助我们理解ppGalNAc-T家族的重要作用。

图4. (A) Enzymatic reactions are performed ‘on-chip’ by ppGalNAc-T2 using UDP-GalNAz (left track) or UDP-GalNAc (right track) as donor substrate. After click chemistry reaction, GalNAz-modified proteins conjugated by alkyne-fluorophore are then detected by a fluorescence slide reader. (B) 226 proteins were identified as substrate candidates of ppGalNAc-T2. (C) 17 selected proteins from p53 network and Tyrosine kinase network were validated by HPA lectin blot in vitro. (D) The O-glycosylation site on p53 was identified by Mass Spectrometry.

针对目前糖生物学研究中存在的高效特异性富集糖蛋白的技术难题，我们在利用磁性纳米材料的基础上，结合生物正交性标记和点击化学等方法，开发了具有选择性富集叠氮标记O-糖基化多肽及蛋白的炔基修饰纳米磁珠，建立了从复杂生物样品中分离富集糖基化蛋白的新方法，并成功应用于糖肽的质谱分析。该富集方法具有高效性和良好的特异性，有望为基于代谢标记的细胞动态糖基化研究提供一种方便有效的手段，也为化学和生物学交叉领域研究提供了新思路。该成果发表在英国皇家化学会的ChemComm杂志上（Chem. Commun., 2012,48:5907-5909）。

图 5. Capture and release of azido glycopeptides with DA-MSPs. 

3、基于糖链生物标志物的疾病早期诊断技术

糖链参与细胞识别、细胞分化、发育、信号转导、免疫应答等各种重要的生命活动。大量研究表明，肿瘤细胞的异常糖基化与肿瘤的发生发展密切相关。糖链有望成为诊断和治疗肿瘤等复杂性疾病的重要靶点。我们利用凝集素富集糖蛋白技术，质谱鉴定糖蛋白糖基化位点、糖链结构的技术，比较不同发展时期差异糖蛋白谱及糖链谱，并通过生物信息学分析筛选与疾病发生发展相关的标志糖蛋白及糖链结构，结合体内外分子生物学验证，将其应用临床大规模血清检测，实现对疾病的早期诊断。

承担科研项目情况：

先后主持和承担了国家973一级子课题项目2项，参与863项目1项，主持国家自然科学基金面上项目4项，国家和上海市科技合作专项项目2项。 

1. ppGalNAc-T在肺癌中的功能研究，2007-03-31。 

2. P19细胞神经分化相关ppGalNAc-T13的功能解析，2009-03-20。 

3. 疾病相关的糖组学研究，2010-03-29。 

科研成果：

1. 在世界上最早揭示了微生物咔唑代谢途径；系统揭示了10种新的O-糖基转移酶基因功能。已发表以Science，PNAS，JBC为代表的学术论文40篇， 申请国内外专利6项。 

2. 研究发现了一种新的定位于内质网的蛋白质O-糖基化调控关键酶多肽N-乙酰氨基半乳糖基转移酶（ppGalNAc-T18 ） 。该酶只存在脊椎动物，虽不具有经典的糖基化活性，但是可以选择性促进同家族其他酶的糖基化活性，影响细胞表面蛋白的糖基化及细胞生长。该研究对教科书上关于蛋白质的O-GalNAc糖基化过程只发生在高尔基体中这一传统概念提出挑战，首次提出了内质网中可能存在新的蛋白质O-GalNAc糖基化调控机制，该成果发表在国际糖生物学研究领域权威杂志《Glycobiogy》上。

3. 针对目前生物学研究中存在的高效特意性富集糖蛋白的技术难题，结合生物正交性标记和点击化学等方法，合成开发了具有选择性富集叠氮标记O-糖基化多肽及蛋白的炔基修饰的新型纳米磁珠，建立了一种从复杂生物样品中分离富集糖基化蛋白的新方法 ， 并成功应用于糖肤的质谱分析 。该富集方法为基于代谢标记的细胞动态糖基化研究提供了一种方便有效的手段。该成果发表在英国皇家化学会所属的《ChemComm》 杂志。

4. 与日本产业技术综合研究所医学糖科学研究中心共建了中日医学糖组学联合实验室 ， 与上海交通大学医学院附属瑞金医院的共同合作 ，综合高通量凝集素芯片技术和快速临床免疫分析技术，初步完成了 《肝纤维化糖链生物标志物的开发和验证》中日合作项目，该技术为复杂疾病的微量血清糖链生物标志物的早期诊断技术开发奠定了基础。

发明专利：

申请国内外发明专利6项，获授权日本专利1项和中国发明专利3项。

1 ppGalNAc-T18特异性多克隆抗体的制备方法 张延;邵栋  【中国专利】 2008-10-30 2009-03-18 

2 CTx在制备诊断结直肠癌药物中的用途 邹霞;张延;杨芳;冯波;郑民华  【中国专利】 2013-10-12 2014-01-22

3 一种针对ppGalNAc-T13多克隆抗体的特异性抗原肽及其制备与应用 张延;庞文杰  【中国专利】 2011-08-17 2011-12-28 

4 富集叠氮标记生物大分子的磁性纳米材料及其制备与应用 张延;王胜;谢文娴 【中国专利】2011-08-17 2012-04-11

5 ppGalNAc-T20抗原及其多克隆抗体的制备方法 张延; 彭灿; 武功冬; 邹霞; 谢文娴 【中国专利】 2010-01-07 2010-09-01 

 

现已发表以Science，PNAS，JBC为代表的学术论文40篇（其中有23篇文章为2006年回国后发表）。 

代表性英文论文：

1. Zou, X., Chi, X., Pan, Y., Du, D., Sun, H., Matsuda, A., Li, W., Kuno, A., Zhang, X., Narimatsu, H., Niu, J., and Zhang, Y*. (2014)."LecT-Hepa facilitates estimating treatment outcome during interferon therapy in chronic hepatitis C patients." Clin Proteomics, 11(1): 44.

2. Yu, D. M., Li, X. H., Mom, V., Lu, Z. H., Liao, X. W., Han, Y., Pichoud, C., Gong, Q. M., Zhang, D. H., Zhang, Y., Deny, P., Zoulim, F., and Zhang, X. X. (2014)."N-glycosylation mutations within hepatitis B virus surface major hydrophilic region contribute mostly to immune escape." J Hepatol, 60(3): 515-22.

3. Tan, B., Matsuda, A., Zhang, Y., Kuno, A., and Narimatsu, H. (2014)."Multilectin-assisted fractionation for improved single-dot tissue glycome profiling in clinical glycoproteomics." Mol Biosyst, 10(2): 201-5.

4. Shen, H., Zhang, X., Zhang, L., and Zhang, Y*. (2014)."Searching O-Glycoproteins with Metabolic Labeling and Two Dimensional Electrophoresis." Life Sci Res, 18(5): 377-381.

5. Zou, X., Feng, B., Dong, T., Yan, G., Tan, B., Shen, H., Huang, A., Zhang, X., Zhang, M., Yang, P., Zheng, M., and Zhang, Y*. (2013)."Up-regulation of type I collagen during tumorigenesis of colorectal cancer revealed by quantitative proteomic analysis." J Proteomics, 94: 473-85.

6. Zhu, X., Gong, Q., Yu, D., Zhang, D., Gu, L., Han, Y., Chen, J., Zhang, Y., and Zhang, X. (2013)."Early serum hepatitis B virus large surface protein level: a stronger predictor of virological response to peginterferon alfa-2a than that to entecavir in HBeAg-positive patients with chronic hepatitis B." J Clin Virol, 57(4): 318-22.

7. Zhang, X. and Zhang, Y*. (2013)."Applications of azide-based bioorthogonal click chemistry in glycobiology." Molecules, 18(6): 7145-59.

8. Tan, B., Qiu, Y., Zou, X., Chen, T., Xie, G., Cheng, Y., Dong, T., Zhao, L., Feng, B., Hu, X., Xu, L. X., Zhao, A., Zhang, M., Cai, G., Cai, S., Zhou, Z., Zheng, M., Zhang, Y. *, and Jia, W. (2013)."Metabonomics identifies serum metabolite markers of colorectal cancer." J Proteome Res, 12(6): 3000-9.

9. Aoki-Kinoshita, K., Sawaki, H., An, H., Campbell, M., Cao, Q., Cummings, R., Hsu, D., Kato, M., Kawasaki, T., Khoo, K., Kim, J., Kolarich, D., Li, X., Liu, M., Matsubara, M., Okuda, S., Packer, N., Ranzinger, R., Shen, H., Shikanai, T., Shinmachi, D., Toukach, P., Yamada, I., Yamaguchi, Y., Yang, P., Ying, W., Yoo, J., Zhang, Y., Zhang, Y., and Narimatsu, H. (2013)."The Fifth ACGG-DB Meeting Report: Towards an International Glycan Structure Repository." Glycobiology, 23(12): 1422-1424.

10. Wang, S., Xie, W., Zhang, X., Zou, X., and Zhang, Y*. (2012)."Disulfide- and terminal alkyne-functionalized magnetic silica particles for enrichment of azido glycopeptides." Chem Commun (Camb), 48(47): 5907-9.

11. Li, X., Wang, J., Li, W., Xu, Y., Shao, D., Xie, Y., Xie, W., Kubota, T., Narimatsu, H., and Zhang, Y*. (2012)."Characterization of ppGalNAc-T18, a member of the vertebrate-specific Y subfamily of UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferases." Glycobiology, 22(5): 602-15.

12. Du, D., Zhu, X., Kuno, A., Matsuda, A., Tsuruno, C., Yu, D., Zhang, Y., Ikehara, Y., Tanaka, Y., Zhang, X., and Narimatsu, H. (2012)."Comparison of LecT-Hepa and FibroScan for assessment of liver fibrosis in hepatitis B virus infected patients with different ALT levels." Clin Chim Acta, 413(21-22): 1796-9.

13. Cheng, Y., Xie, G., Chen, T., Qiu, Y., Zou, X., Zheng, M., Tan, B., Feng, B., Dong, T., He, P., Zhao, L., Zhao, A., Xu, L. X., Zhang, Y. *, and Jia, W. (2012)."Distinct urinary metabolic profile of human colorectal cancer." J Proteome Res, 11(2): 1354-63.

14. Wang, J., Peng, C., and Zhang, Y*. (2011)."Catalytic activity and structure analysis of the intial glycosyltransferase of O-glycosylation." Chin Bull Life Sci 23(7): 619-629.

15. Zhang, X. W., Yan, X. J., Zhou, Z. R., Yang, F. F., Wu, Z. Y., Sun, H. B., Liang, W. X., Song, A. X., Lallemand-Breitenbach, V., Jeanne, M., Zhang, Q. Y., Yang, H. Y., Huang, Q. H., Zhou, G. B., Tong, J. H., Zhang, Y., Wu, J. H., Hu, H. Y., de The, H., Chen, S. J., and Chen, Z. (2010)."Arsenic trioxide controls the fate of the PML-RARalpha oncoprotein by directly binding PML." Science, 328(5975): 240-3.

16. Wang, S., Zou, X., and Zhang, Y*. (2010)."Recent Advances in Mass Spectrometry Based Analysis of Protein O-glycosylation." Prog. Chem., 22(12): 2388-2395.

17. Peng, C., Togayachi, A., Kwon, Y. D., Xie, C., Wu, G., Zou, X., Sato, T., Ito, H., Tachibana, K., Kubota, T., Noce, T., Narimatsu, H., and Zhang, Y*. (2010)."Identification of a novel human UDP-GalNAc transferase with unique catalytic activity and expression profile." Biochem Biophys Res Commun, 402(4): 680-6.

18. Zhang, Q. Y., Mao, J. H., Liu, P., Huang, Q. H., Lu, J., Xie, Y. Y., Weng, L., Zhang, Y., Chen, Q., Chen, S. J., and Chen, Z. (2009)."A systems biology understanding of the synergistic effects of arsenic sulfide and Imatinib in BCR/ABL-associated leukemia." Proc Natl Acad Sci U S A, 106(9): 3378-83.

19. Wei, H., Shen, J., Pang, X., Ding, D., Zhang, Y., Zhang, B., Lu, H., Wang, T., Zhang, C., Hua, X., Cui, L., and Zhao, L. (2008)."Fatal infection in human flora-associated piglets caused by the opportunistic pathogen Klebsiella pneumoniae from an apparently healthy human donor." J Vet Med Sci, 70(7): 715-7.

20. Li, M., Wang, B., Zhang, M., Rantalainen, M., Wang, S., Zhou, H., Zhang, Y., Shen, J., Pang, X., Zhang, M., Wei, H., Chen, Y., Lu, H., Zuo, J., Su, M., Qiu, Y., Jia, W., Xiao, C., Smith, L. M., Yang, S., Holmes, E., Tang, H., Zhao, G., Nicholson, J. K., Li, L., and Zhao, L. (2008)."Symbiotic gut microbes modulate human metabolic phenotypes." Proc Natl Acad Sci U S A, 105(6): 2117-22.

21. Zhang, M., Liu, B., Zhang, Y., Wei, H., Lei, Y., and Zhao, L. (2007)."Structural shifts of mucosa-associated lactobacilli and Clostridium leptum subgroup in patients with ulcerative colitis." J Clin Microbiol, 45(2): 496-500.

22. Li, K., Guan, W., Wei, G., Liu, B., Xu, J., Zhao, L., and Zhang, Y*.(2007)."Phylogenetic analysis of intestinal bacteria in the Chinese mitten crab (Eriocheir sinensis)." J Appl Microbiol, 103(3): 675-82.

23. Shen, J., Zhang, B., Wei, G., Pang, X., Wei, H., Li, M., Zhang, Y., Jia, W., and Zhao, L. (2006)."Molecular profiling of the Clostridium leptum subgroup in human fecal microflora by PCR-denaturing gradient gel electrophoresis and clone library analysis." Appl Environ Microbiol, 72(8): 5232-8.

24. Cheng, L., Tachibana, K., Iwasaki, H., Kameyama, A., Zhang, Y., Kubota, T., Hiruma, T., Tachibana, K., Kudo, T., Guo, J. M., and Narimatsu, H. (2004)."Characterization of a novel human UDP-GalNAc transferase, pp-GalNAc-T15." FEBS Lett, 566(1-3): 17-24.

25. Zhang, Y., Iwasaki, H., Wang, H., Kudo, T., Kalka, T. B., Hennet, T., Kubota, T., Cheng, L., Inaba, N., Gotoh, M., Togayachi, A., Guo, J., Hisatomi, H., Nakajima, K., Nishihara, S., Nakamura, M., Marth, J. D., and Narimatsu, H. (2003)."Cloning and characterization of a new human UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase, designated pp-GalNAc-T13, that is specifically expressed in neurons and synthesizes GalNAc alpha-serine/threonine antigen." J Biol Chem, 278(1): 573-84.

26. Wang, H., Tachibana, K., Zhang, Y., Iwasaki, H., Kameyama, A., Cheng, L., Guo, J., Hiruma, T., Togayachi, A., Kudo, T., Kikuchi, N., and Narimatsu, H. (2003)."Cloning and characterization of a novel UDP-GalNAc:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase, pp-GalNAc-T14." Biochem Biophys Res Commun, 300(3): 738-44.

27. Iwasaki, H., Zhang, Y., Tachibana, K., Gotoh, M., Kikuchi, N., Kwon, Y. D., Togayachi, A., Kudo, T., Kubota, T., and Narimatsu, H. (2003)."Initiation of O-glycan synthesis in IgA1 hinge region is determined by a single enzyme, UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 2." J Biol Chem, 278(8): 5613-21.

28. Guo, P., Zhang, Y., Zhang, X. Y., Chen, H. L., Zhang, Y., Wang, H., and Narimatsu, H. (2003)."Analysis of lewis antigens on cell surface and alpha1,3 fucosyltransferase subtypes in H7721 human hepatocarcinoma cells." J Exp Clin Cancer Res, 22(1): 135-9.

29. Kudo, T., Iwai, T., Kubota, T., Iwasaki, H., Takayma, Y., Hiruma, T., Inaba, N.,Zhang, Y., Gotoh, M., Togayachi, A., and Narimatsu, H. (2002)."Molecular cloning and characterization of a novel UDP-Gal:GalNAc(alpha) peptide beta 1,3-galactosyltransferase (C1Gal-T2), an enzyme synthesizing a core 1 structure of O-glycan." J Biol Chem, 277(49): 47724-31.

30. Iwai, T., Inaba, N., Naundorf, A., Zhang, Y., Gotoh, M., Iwasaki, H., Kudo, T., Togayachi, A., Ishizuka, Y., Nakanishi, H., and Narimatsu, H. (2002)."Molecular cloning and characterization of a novel UDP-GlcNAc:GalNAc-peptide beta1,3-N-acetylglucosaminyltransferase (beta 3Gn-T6), an enzyme synthesizing the core 3 structure of O-glycans." J Biol Chem, 277(15): 12802-9.

31. Hagiwara, H., Kunihiro, S., Nakajima, K., Sano, M., Masaki, H., Yamamoto, M., Pak, J. W., Zhang, Y., Takase, K., Kuwabara, I., Maruyama, I. N., and Machida, M. (2002)."Affinity selection of DNA-binding proteins from yeast genomic DNA libraries by improved lambda phage display vector." J Biochem, 132(6): 975-82.

32. Guo, J. M., Zhang, Y., Cheng, L., Iwasaki, H., Wang, H., Kubota, T., Tachibana, K., and Narimatsu, H. (2002)."Molecular cloning and characterization of a novel member of the UDP-GalNAc:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase family, pp-GalNAc-T12." FEBS Lett, 524(1-3): 211-8.

33. Gotoh, M., Sato, T., Akashima, T., Iwasaki, H., Kameyama, A., Mochizuki, H., Yada, T., Inaba, N., Zhang, Y., Kikuchi, N., Kwon, Y. D., Togayachi, A., Kudo, T., Nishihara, S., Watanabe, H., Kimata, K., and Narimatsu, H. (2002)."Enzymatic synthesis of chondroitin with a novel chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase that transfers N-acetylgalactosamine to glucuronic acid in initiation and elongation of chondroitin sulfate synthesis." J Biol Chem, 277(41): 38189-96.

34. Cheng, L., Tachibana, K., Zhang, Y., Guo, J., Kahori Tachibana, K., Kameyama, A., Wang, H., Hiruma, T., Iwasaki, H., Togayachi, A., Kudo, T., and Narimatsu, H. (2002)."Characterization of a novel human UDP-GalNAc transferase, pp-GalNAc-T10." FEBS Lett, 531(2): 115-21.

35. Zhang, Y., Pak, J. W., Maruyama, I. N., and Machida, M. (2000)."Affinity selection of DNA-binding proteins displayed on bacteriophage lambda." J Biochem, 127(6): 1057-63.

36. Nakajima, K., Kunihiro, S., Sano, M., Zhang, Y., Eto, S., Chang, Y. C., Suzuki, T., Jigami, Y., and Machida, M. (2000)."Comprehensive cloning and expression analysis of glycolytic genes from the filamentous fungus, Aspergillus oryzae." Curr Genet, 37(5): 322-7.

37. Zhang, Y., Arai, H., Sambongi, Y., Igarashi, Y., and Kodama, T. (1998)."Heterologous Expression of Hydrogenobacter thermophilus Cytochrome c-552 in the Periplasm of Pseudomonas aeruginosa." J. Ferment. Bioeng., 85: 346-349.

38. Kimura, T., Zhang, Y., Kodama, T., and Omor, T. (1996)."Isolation and characterization of Tn 5-induced mutants deficient in carbazole catabolism." FEMS Microbiol. Lett., 135: 65-70.

39. Arai, H., Zhang, Y., Sambongi, Y., Igarashi, Y., and Kodama, T. (1995)."Production of Recombinant Cytochrome c-551 in a Pseudomonas aeruginosa Mutant Strain." J. Ferment. Bioeng., 79: 489-492. 

40. Ouchiyama, N., Zhang, Y., Omor, T., and Kodama, T. (1993)."Biodegradation of Carbazole by Pseudomonas spp. CA06 and CA10." Biosci., Biotechnol., Biochem., 57: 455-460.

代表性中文论文：

1 蛋白质O-GalNAc糖基转移酶(ppGalNAc-T)的抑制剂研究 刘峰; 许之珏; 吴方; 张延2015中国酶工程与糖生物工程学术研讨会论文摘要集 2015-08-21

2 α1-酸性糖蛋白糖链检测对慢乙肝相关肝硬化的早期诊断及其临床应用 张东华; 朱雪娟; 邹霞; 张延; 张欣欣; 于德敏 现代免疫学 2015-07-30

3 代谢性标记结合二维电泳寻找O-糖基化蛋白的研究 申浩; 张秀; 张蕾; 张延 生命科学研究 2014-10-30

4 私募股权投资的企业IPO抑价及超额收益分析 张延 上海交通大学 2014-05-24

5 私募股权投资是否提高了目标企业的生产效率——基于中国上市公司的实证分析 费一文; 朱熹; 张延 上海管理科学 2012-10-20

6 O-糖基化起始糖基转移酶的活性与结构研究 王静; 彭灿; 张延 生命科学 2011-07-15

7 基于质谱的蛋白质O-糖基化分析 王胜; 邹霞; 张延 化学进展 2010-12-24

8 结膜松弛症泪液蛋白质肽质量指纹谱分析 项敏泓; 张兴儒; 李青松; 张梦晖; 鲁静; 张群业; 张延 眼科新进展 2010-01-05

9 一种与多肽：N-乙酰氨基半乳糖转移酶结构类似基因的研究 邵栋; 谢春燕; 程腊梅; 成松久; 张延 2008年全国糖生物学学术会议论文摘要 2008-06-01

10 PCR-DGGE对长江河口八种野生鱼类肠道菌群多样性的比较研究 李可俊; 管卫兵; 徐晋麟; 张延; 赵立平 中国微生态学杂志 2007-06-30

11 胆管结扎对大鼠肠道双歧杆菌组成的影响 赵琴丽; 龙爱华; 刘平; 庞小燕; 张梦晖; 张延; 赵立平 中国微生态学杂志 2007-04-30

12 轮状病毒感染对肠道菌群影响的研究 张美玲; 张梦晖; 杜惠敏; 庞小燕; 张延; 赵立平 第二届中国青年学者微生物遗传学学术研讨会论文集 2006-10-01

13 不同热剂量的超声热疗对肝癌动物模型的作用 赵洪; 蔡端; 张延龄; 张群华; 陈亚珠 肝胆外科杂志 2000-06-25

14 利用微生物转化丙烯腈成丙烯酰胺的研究Ⅱ、产腈水合酶菌种的发酵条件的研究 孙韦强; 张延; 余正齐; 汪莉; 杨钧; 尹光琳 ; 李族光 石油学报(石油加工) 1989-04-02

15 利用微生物转化丙烯腈成丙烯酰胺的研究Ⅰ.产腈水合酶菌种的分离筛选和鉴定 孙韦强; 伍登熙; 尹光琳; 余正齐; 李族光; 张刚; 张延; 周建龙; 孙俊; 陆光; 汪莉; 杨芳晓; 杨钧 石油学报(石油加工) 1988-12-30

来自上海交通大学系统生物医学研究院的张延研究员介绍了有关《蛋白质的O-糖基化修饰研究》的报告。

张老师首先指出糖链修饰是一种重要的蛋白质翻译后修饰，细胞内50%以上的蛋白质都有糖链修饰。糖链参与了细胞识别、细胞分化、发育、信号传导、免疫应答等各种重要生命活动。人类重大疾病如神经退行性疾病、心血管疾病、代谢性疾病、免疫性疾病以及肿瘤等均伴随有蛋白质糖基化异常的发生。因此蛋白质的糖基化修饰研究是蛋白质组学研究的重要内容。张老师主要通过研究 O-GalNAc糖基转移酶的糖基化修饰特性，通过利用UDP-GalNAc衍生物糖探针的荧光标记技术，结合质谱及多肽蛋白质芯片技术，建立了一种高通量发现蛋白质O-糖基化的新策略。

来自南京大学化学化工学院的梁靓老师介绍了题为《用于糖蛋白富集的团队硼亲和方法研究》的报告。

目前用于糖蛋白富集的主要方法有凝集素亲和法、肼化学法、亲水作用色谱法和硼亲和色谱法等。硼亲和方法与其他几种方法相比较具有三个显著的优点：1)共价结合，专一性好，亲和力强；2)可逆反应，结合/解吸过程容易控制；3)在酸性条件下解吸，解吸条件的质谱兼容性好。这些优点使得取代硼酸是非常理想的亲和配基，特别适合于以质谱为核心的蛋白质组学分析方法。然而，常规的取代硼酸具有两个明显的缺点：1)在中性pH下的亲和能力极弱，必须在碱性pH下才能与顺式二羟基化合物结合，这造成了操作上的不便，增加了样品变性的危险；2)在碱性pH时取代硼酸带负电，与样品及样品基体间存在静电相互作用，因而导致专一性的下降。

为了同时解决以上两个问题，梁老师所在课题组提出了“团队硼亲和”的原理以及相应的方法。利用该方法制备了团队硼亲和磁性纳米颗粒和团队硼亲和MALDI靶板，其优异的亲和力和专一性得到验证，成功实现了在中性pH条件下对糖蛋白的专一性富集和纯化。

来源：分析测试百科 2010-5-16

花王（中国）研究开发中心有限公司与上海交通大学

近日，花王（中国）研究开发中心有限公司与上海交通大学系统生物医学研究院共同合作协议的签字仪式在上海交通大学系统生物研究院顺利举行。花王（中国）研究开发中心有限公司梅本勲总经理与上海交通大学系统生物医学研究院林志新常务副院长就双方的研究合作达成一致并签署协议。宣告了双方在基础研究领域开展密切合作，旨在集结双方先进的研究力量；并将研究成果还原社会。

据悉，此次与花王（中国）研究开心具体开展合作的是上海交通大学系统生物医学院张延教授所领导的课题小组。张教授在其所在的生物医学相关领域处于前沿位置。对于与花王的合作，张教授充满期待。她表示，花王是非常知名的日本企业，研发水平先进。高校的研究不能局限于闭门造车，希望通过与企业的合作将研究成果与实际生活相结合，将成果还原社会，真正地为大众所用。　　

签字仪式后，花王（中国）一行还参观了张延教授的实验室，花王（中国）负责该项目的基础研究部荒胜俊部长表示，花王非常高兴与中国一流大学的优秀的研究组进行合作，他期待双方在不久的将来能够迎来可喜的合作硕果。 

来源：爱美女性网 2012-01-29 

2010年5月15日，蛋白质组数据处理暨全国生物质谱学术交流会”在云南省丽江市召开。会议为期两天，主要讨论了蛋白质组学技术和应用、数据挖掘和生物质谱等方面的现状及其进展。在所有的大会报告中，除一些关于蛋白质组学技术最新研究进展的大会特邀报告外，第一天的专家报告集中讨论了糖蛋白组的最新分析技术与研究进展，第二天的报告集中讨论了蛋白质数据处理技术，包括蛋白质组生物数据库及分析平台的构建、数据统计分析方法的研究等方面。

作为会议议题的主要内容之一，糖蛋白广泛存在于生物体内，是重要的生物活性物质，具有很多重要功能，关于其的最新研究进展已受到国内外科学家们的高度关注。在本次大会上，南京大学的梁亮博士、美国约翰霍普金斯大学李岩博士、上海交通大学系统生物医学研究院的张延研究员等多位专家学者作了关于糖蛋白最新研究进展的报告。

报告题目：蛋白质的O-糖基化修饰研究

报告人：上海交通大学系统生物医学研究院张延研究员

糖链修饰是一种重要的蛋白质翻译后修饰。细胞内50%以上的蛋白质都有糖链修饰。糖链参与了细胞识别、细胞分化、发育、信号传导、免疫应答等各种重要生命活动。按糖链与氨基酸的糖苷键结合方式的不同，真核生物中蛋白质糖基化可分为N-糖基化修饰和O-糖基化修饰，蛋白质的O-糖基化修饰中最主要的O-GalNAc修饰。

张延研究员通过对O-GalNAc糖基转移酶的糖基化修饰特性进行研究，利用UDP-GalNAc衍生物糖探针的荧光标记技术，结合质谱及多肽蛋白质芯片技术，建立了一种高通量发现蛋白质O-糖基化的新策略。

来源：仪器信息网 2010/5/19

荣誉奖励：

2007年，入选上海浦江人才。

欧洲蛋白质组学协会的Jounal of Proteomics杂志近日在线发表了上海交通大学系统生物医学研究院张延课题组通过血清蛋白质组学手段寻找结直肠癌相关标志物研究的最新成果。

 

该研究运用相对定量血清蛋白质组学和分子生物学研究技术，系统性地解析了不同分期结直肠癌病人血清、组织样本中细胞外基质组分--I型胶原蛋白在结直肠癌发生发展中的生物学行为。首次发现肿瘤病人血清中I型胶原蛋白的代谢性降解产物羧基末端肽（CTx）的含量与结直肠癌病人的分期呈正相关，血清中CTx的变化与病人的预后生存期相关。表明血清中CTx标志物检测对结直肠癌预后的临床诊断具有参考意义。研究提示伴随肿瘤生长所产生的代谢性特异降解多肽片段，是未来血清肿瘤生物标志物发现的重要目标候选分子群。研究同时为血清蛋白组学手段在临床检测上的应用提供了功能组织学佐证。 

该研究由张延课题组与上海交大医学院附属瑞金医院郑民华教授课题组共同合作完成。第一作者为博士生邹霞和冯波医生。

附：文章链接 http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1874391913005356